Course
Bioinformatyka Sekwencji Biologicznych 2 (2 rok Bioinformatyki)Teaching method
- Lectures (10 h) [MsTeams]
- Labs (20 h) [MsTeams / Sala Dostępowa]
Teacher
- prof. dr hab. Wojciech Karlowski
- wmk@amu.edu.pl
- dr Maciej Szymański
- mszyman@amu.edu.pl
Lectures Godzina: 14:15, MsTeams
| # | Date | Lecture | Topic |
|---|---|---|---|
| 01 | 28.02.2022 | Wykład 1 | Linux i NCBI E-Utilities |
| 02 | 07.03.2022 | Wykład 2 | Programowanie dynamiczne |
| 03 | 14.03.2022 | Wykład 3 | Matryce punktowania |
| 04 | 21.03.2022 | Wykład 4 | MSA i filogenetyka |
| 05 | 28.03.2022 | Wykład 5 | Metody "alignment-free" i adnotacja funkcjonalna sekwencji |
Labs wtorek, godz. 10:30, sala S2
| # | Date | Topic | Lab |
|---|---|---|---|
| 01 | 01.03.2022 | Podstawy obsługi systemu Linux | lab1 [pdf / docx] |
| 02 | 08.03.2022 | NCBI E-Utilities (Entrez Direct) | lab2 [pdf / docx] |
| 03 | 15.03.2022 | Programowanie dynamiczne (przyrównanie sekwencji) | lab3 [pdf / docx] |
| 04 | 22.03.2022 | DotPlot, BLAST | lab4 [pdf / docx] |
| 05 | 29.03.2022 | Przyrównanie wielu sekwencji + filogenetyka | lab5 [GitHub] |
| 06 | 05.04.2022 | Profile sekwencji, Adnotacja funkcjonalna i metody alignment-free | lab6 [GitHub] |
| 07 | 12.04.2022 | Kolokwium | - |