Course

Bioinformatyka Sekwencji Biologicznych 2 (2 rok Bioinformatyki)

Teaching method

  • Lectures (10 h) [godz. 14:00, sala C]
  • Labs (20 h) [sala S2]

Teacher

prof. dr hab. Wojciech Karlowski
wmk@amu.edu.pl
dr Andrzej Zielezinski
andrzejz@amu.edu.pl

E-learning

Dyżur on-line (Skype: combio.pl)
poniedziałek (14:00-15:30)
Dyżur on-line (Skype: a.zielezinski)
piątek (8:00-10:15)

Zagadnienia do egzaminu [pdf]


Lectures Godzina: 14:00, sala C

# Date Lecture Topic
01 02.03.2020 Wykład 1 Linux i NCBI E-Utilities
02 09.03.2020 Wykład 2 Programowanie dynamiczne

Labs

Ćwiczenia na GitHub

# Date Topic Lab
01 03.03.2020 Podstawy obsługi systemu Linux Lab01
02 10.03.2020 NCBI E-Utilities (Entrez Direct) Lab02

E-learning

# Date Topic Lab
03 23.03.2020 Programowanie dynamiczne (Dot-plot, przyrównanie sekwencji) E-learning Lab03
04 30.03.2020 BLAST, profile sekwencji E-learning Lab04
05 06.04.2020 Przyrównanie wielu sekwencji + filogenetyka E-learning Lab05
06 13.04.2020 Adnotacja funkcjonalna i metody alignment-free E-learning Lab06
07 26.06.2020 Zaliczenie ćwiczeń E-learning MsTeams